Nguyên thủy cơ sở này có tên là Quốc tử giám, học viện cao nhất của vương quốc Cao Ly do vua Thành Tông sáng lập vào tháng 11 năm 992. Tháng 6 năm 1304, cơ sở này đổi tên thành "Thành Quân Quán" và sau đó được chuyển về địa điểm ngày nay ở Seongmun-gwan vào năm 1367 ở Kaesong dưới thời Cung Mẫn Vương.

Khi nhà Cao Ly đổ, nhà Lý Triêu Tiên lên làm vua 1392 thì vua Thái Tổ sai chuyển Thành Quân Quán về Hán Thành, tức Seoul. Đồng thời triều đình cũng cho lập 360 Hương giáo trên toàn quốc kể từ tháng 7 năm 1398, tạo nên một hệ thống giáo dục quốc gia.

Thành Quân Quán không may bị cháy năm 1400 nhưng được xây lại năm 1407, rồi lại tái thiết lần nữa vào năm 1601 sau khi bị phá hủy trong Chiến tranh Nhật Bản-Triều Tiên (1592-1598).

Dưới thời Nhật thuộc (1910–1945), triều đình Triêu Tiên mất thực quyền nên Thành Quân Quán bị giải thể, đổi thành một tư thục mang tên Kinh Học viện (Gyunghakwon).

Sau năm 1945, Hàn Quốc khôi phục chủ quyền, Kinh Học viện lấy lại tên tên cũ: Thành Quân Quán và khai triển thêm thành Đại học Sungkyunkwan. Tòa điện Thành Quân Quán hiện nay được gìn giữ như một di tích văn hóa.